冷却塔有藻类时，可以采取以下处理方法：

物理清洗：使用机械方法，如刮刀、高压水射流、超声波等，去除冷却塔中的藻类和水垢。

化学清洗：使用化学药剂，如酸、碱、有机溶剂等，去除冷却塔中的藻类和水垢。需要注意的是，使用化学药剂时需要控制使用量和浸泡时间，避免对冷却塔造成损害。

生物清洗：使用微生物或其代谢产物，如酶、脂肪酸等，去除冷却塔中的藻类和水垢。生物清洗方法具有环保、无污染的优点，但需要控制微生物的生长速度和代谢产物的活性。

在处理冷却塔中的藻类及水垢时，需要注意以下几点：

定期检查：定期检查冷却塔的运行状况，及时发现并处理藻类及水垢等问题。

合理使用水：合理使用水源，避免不同水源之间的交叉污染，导致藻类及水垢的产生。

保持冷却塔内部清洁：保持冷却塔内部的清洁，防止藻类及水垢的滋生。

调整运行参数：根据实际情况调整冷却塔的运行参数，如水流速度、风量等，避免藻类及水垢的产生。

做好维护保养：定期对冷却塔进行维护保养，保证其正常运行，防止藻类及水垢的滋生。

总之，对于冷却塔中的藻类及水垢问题，需要采取合适的处理方法，并注意日常维护和保养，保证冷却塔的正常运行。